Санаторий «Бештау» расположен в самом центре особо охраняемого эколого-курортного региона Кавказских Минеральных Вод, у подножия горы Железной на высоте 650 м над уровнем моря, в лесопарковой зоне города Железноводск, в 10-15 минутах ходьбы от источников минеральных вод «Славяновская», «Смирновская». Свой питьевой источник есть и на территории самого санатория
Санаторий «Бештау» находится в 15 км от международного аэропорта «Минеральные Воды» и от железнодорожного вокзала г. Минеральные Воды.